JNDI연결 실패 이유는 여러가지가 있습니다. 코드의 문제가 아니라면 대부분은 프로그램간의 버전 충돌등이 원인이 될 수 있습니다.
아무래도 하나의 회사에서 나온 개발툴이 아니라 다양한 개발자나 회사에서 개발된 오픈 소스이기 때문이죠.
이럴 경우엔 각각 버전을 바꿔가면서 테스트를 해보는 수밖에는 없습니다.
물론 버전 충돌이 아니라 다른 쪽의 이유일 수도 있습니다.
JNDI연결이 수월치 않을 경우에는 그냥 일반 커넥션 풀 클래스를 사용하시는 것도 고려해 보실 수 있겠습니다.